Фамилия Балтийская принадлежит к относительно редкому типу русских фамилий, образованных от географических названий. В основе лежит название Балтийского моря, но путь, которым это слово стало фамилией, не так прямолинеен, как кажется.

Если смотреть на суффикс, то фамилия имеет форму прилагательного женского рода с окончанием -ая. В русской традиции такие фамилии чаще всего носили женщины из духовного сословия или из дворянских семей, где фамилия была семинарской или искусственной. Мужской вариант — Балтийский. Семинарии в XVIII–XIX веках нередко давали будущим священникам «благозвучные» фамилии по названиям морей, рек, городов или церковных праздников. Балтийский могли присвоить воспитаннику, родом с побережья Балтики, либо просто как торжественное, «морское» прозвище в стенах училища.

Вторая версия, более прозаичная, — происхождение от прозвища Балтиец. Так могли называть человека, который долго жил в Прибалтике, торговал с балтийскими портами или служил на Балтийском флоте. Прозвище закреплялось за потомками, и к началу XX века оформилось в фамилию Балтийский/Балтийская. В этом случае суффикс -ский/-ская указывает на принадлежность: «из тех, кто связан с Балтикой».

Интересно, что фамилия почти не встречается в старых писцовых книгах и ревизских сказках — она слишком «книжная» для крестьянской среды. Основной ареал бытования — северо-запад России, Санкт-Петербург и города бывшей Лифляндской губернии. Встречается она и у потомков обрусевших немцев или шведов, которые русифицировали свои фамилии по месту жительства.

Споров о происхождении немного: обе версии (семинарская и прозвищная) правдоподобны, но первая — более частая для фамилий на -ский. Если ваши предки были из духовного сословия, то корни стоит искать в семинарских списках XIX века. Если же из военных или купцов — скорее всего, прозвище по службе или торговле.