Фамилия Балуков образована от прозвища или нецерковного имени Балук. В его основе лежит глагол «баловать». Чаще всего Балуком называли баловника — человека несерьёзного, склонного к шалостям и розыгрышам. В старину таких людей характеризовали пословицами: «Балованного парня не перебалуешь» (то есть не переучишь), «Баловством хлеба не добудешь».

Однако есть и другая, не менее вероятная версия. Имя Балук могли дать не за проказы, а, наоборот, из-за чрезмерной любви и опеки. В крестьянской среде «баловнем» нередко называли горячо любимого, избалованного родителями ребёнка. В этом случае мирское имя выполняло функцию оберега или просто отражало отношение к малышу в семье.

Модель образования фамилии простая и типичная для русского севера и центральных областей: суффикс -ов присоединялся к основе Балук, указывая на принадлежность потомка к роду Балука. Сын, внук или правнук человека по прозвищу Балук становился Балуковым.

С точки зрения словообразования фамилия Балуков стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Балашов (от Балаш — баловник, шалун) и Балуев (от Балуй). Все они образованы от однокоренных прозвищ, но различаются суффиксальными вариантами, что говорит о независимом возникновении в разных регионах.

Географически фамилия Балуков встречается не повсеместно. Основные очаги — Поволжье и прилегающие области, где диалектное слово «балук» (шалун, проказник) было в ходу. Встречается она и в среде старообрядцев, что может указывать на давнюю фиксацию прозвища в документах ещё до раскола.

Таким образом, носитель фамилии Балуков может с равной вероятностью происходить от озорника, любившего подшутить, или от «баловня» — ребёнка, которого баловали с младенчества. Оба значения укладываются в одну смысловую модель.