Фамилия Баркарь — редкий пример, где суффикс -арь не просто указывает на профессию, а прямо называет человека по роду занятий, связанному с водой. В русском языке суффикс -арь (как в словах «пекарь», «знахарь») образует названия деятеля. Основа здесь — «барка», плоскодонное речное судно без палубы, которое использовали для перевозки тяжелых грузов по Волге, Днепру и другим рекам. Баркарь — это не владелец, а скорее работник: тот, кто управлял баркой, грузил или разгружал её, то есть речной перевозчик или бурлак.

В румынском языке есть слово barcă — «лодка», а в украинском и белорусских говорах «барка» означала и большую лодку, и баржу. Поэтому фамилия могла сложиться и в западнорусских землях, где славянские и романские языки соприкасались. Модель образования — чисто славянская, хотя основа интернациональна: похожие фамилии есть у поляков (Barkarz) и молдаван.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто давали по отцу, Баркарь — это прозвище, закрепившееся за самим носителем. Скорее всего, первый Баркарь был не просто лодочником, а человеком, чья профессия бросалась в глаза: хозяин барки, опытный кормчий или артельщик, нанимавший бурлаков. Географически фамилия тяготеет к югу России и Украине — регионам крупных речных путей. Встречается она редко, что неудивительно: прозвища по ремеслу обычно давали конкретным людям, а не целым династиям, и фамилии на -арь не получили такого массового распространения, как патронимы на -ов.