Фамилия Баторин образована от прозвища Батора. Чаще всего его возводят к слову «батура» — в старых говорах так называли упрямого, несговорчивого человека или, наоборот, рослого, видного мужчину. Прозвище могло закрепиться и за тем, кто отличался крепким телосложением, и за тем, с кем было трудно найти общий язык — оба значения бытовали параллельно.

Сама модель фамилии типична для русского севера и восточных регионов: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын Баторы). В отличие от фамилий на -ов, которые чаще встречаются в центральной и южной России, -ин — характерная черта новгородских, вятских и поморских земель. Впрочем, фамилия Баторин встречается и в других областях, что говорит о её давнем и широком распространении.

Интересно, что слово «батура» имеет и тюркские параллели: в ряде тюркских языков «батыр» означает «богатырь», «герой». Не исключено, что в некоторых случаях прозвище Батора могло возникнуть на стыке славянской и тюркской традиций, особенно в смешанных регионах Поволжья. Однако для русского ономастикона более вероятно исконное славянское происхождение — от глагола «батурить» (упрямиться, перечить) или от диалектного «батура» (высокий, нескладный человек).

Таким образом, носитель фамилии Баторин — потомок человека по прозвищу Батора, которое либо описывало его характер, либо давалось по внешнему признаку. Других версий, например, связи с венгерским родом Батори, для русской фамилии нет — это случайное звуковое совпадение.