Фамилия Бекендиев — редкий случай, когда её происхождение почти наверняка указывает на конкретный народ и регион, но при этом оставляет простор для догадок о личной истории предка. Судя по структуре, перед нами типичная русифицированная фамилия тюркского происхождения, образованная по модели «основа + суффикс -ев». Суффикс здесь не несёт смысловой нагрузки, а лишь адаптирует нерусское имя или прозвище к русской грамматике, отвечая на вопрос «чей?».

Основа фамилии — «Бекенди». Скорее всего, это имя собственное, которое в тюркских языках (вероятнее всего, казахском или киргизском) могло быть составным. Первая часть «Бек» (или «Би») — широко распространённый титул, означающий «господин», «князь», «вождь». Вторая часть «-енди» — менее прозрачна. Здесь возможны две версии. Первая: это искажённое при написании «-анды» или «-енды», что в некоторых диалектах даёт значение «подобный», «равный». Тогда «Бекенди» можно перевести как «подобный беку» или «равный господину» — так могли назвать сына или младшего родича знатного человека, чтобы подчеркнуть его статус, не давая формального титула.

Вторая версия, более правдоподобная с точки зрения тюркской ономастики: «Бекенди» — это вариант имени Бекен, распространённого у казахов и киргизов. Имя Бекен — уменьшительно-ласкательная форма от имён с компонентом «бек» (например, Бекжан, Бекзат). А суффикс «-ди» (или «-ды») в данном случае мог быть притяжательным аффиксом в составе фамилии на языке оригинала, который при русификации просто застыл в основе. То есть изначально фамилия могла звучать как «Бекенди» (принадлежащий Бекену), а русское окончание -ев только закрепило эту форму.

Таким образом, носитель фамилии Бекендиев — потомок человека, которого в тюркской среде звали Бекен или прозывали «бекенди». Это указывает на его происхождение из среды кочевников или полукочевников Средней Азии, вероятнее всего — с территории современного Казахстана или Кыргызстана. Фамилия не дворянская и не крестьянская в русском понимании, а отражает социальную структуру степного общества, где титул «бек» был показателем знатности, но не обязательно давал землю и крепостных. Скорее всего, предок был из числа «белой кости» (ак-суйек) — родовой аристократии, но не обязательно высшего ранга. Фамилия могла возникнуть в XIX — начале XX века, когда при переселении в Российскую империю или при записи в метрические книги кочевникам давали фамилии по имени отца или деда.