Фамилия Берне — компактная, но неоднозначная по происхождению. Скорее всего, она пришла из немецкоязычной среды, где могла быть усечённой формой имени Бернхард. Древнегерманская основа bern означает «медведь», а hard — «сильный» или «смелый». Получается, что именование Берне можно понять как «отважный, как медведь». Такая модель — сокращение полного имени до короткого обиходного варианта — типична для немецких фамилий, образованных от личных имён.

Но есть и другие версии. Например, фамилия Берне могла быть немецким переосмыслением английской фамилии Борне. Та, в свою очередь, восходит к древнеанглийскому burna — «ручей». В этом случае прозвище Борне давали человеку, чей дом стоял у воды. Если эта связь верна, то Берне — это «ручейный» топонимический след, только сменивший язык.

Третья гипотеза выводит фамилию из латышского прилагательного bērna — «детский, незрелый, ребячий». Тогда Берне могло быть прозвищем подростка или молодого человека. Версия менее распространённая, но лингвистически допустимая, если учитывать балтийское влияние в некоторых регионах.

Судя по архивным записям, носители фамилии встречались в разных концах Российской империи. В Книге памяти Новосибирской области упоминаются Алексей Иванович Берне (1893 года рождения, из Костромской губернии) и Иосиф Петрович Берне (1899 года, из АССР Немцев Поволжья). А в Книге памяти Республики Киргизия записан Михаил Ефимович Берне, родившийся в 1892 году в Калининской области. Разброс мест говорит о том, что фамилия не была жёстко привязана к одной территории, хотя немецкое Поволжье — характерная точка для немецких фамилий в России.

Среди известных однофамильцев — немецкий писатель и публицист Людвиг Берне. Его фамилия — та же самая, без изменений, что подтверждает её германские корни. Но стоит помнить: в каждом конкретном случае происхождение могло быть разным — от прозвища до топонима, и точную причину появления фамилии у конкретной семьи без генеалогического исследования не установить.