Фамилия Бескишева — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все прочие версии. В русском языке слово «бескиш» не существует, и основа фамилии явно тюркская. Скорее всего, в её основе лежит тюркское «киш» — зима, зимовье (ср. казахское «кыстау», татарское «кышлау» — зимовка). Приставка «бес-» в тюркских языках означает «пять». Таким образом, исходное прозвище или название местности «Бескиш» — это «пять зимовий» или «пять зимовок». Так могли назвать место, где стояло пять отдельных зимних стоянок, или человека, который пережил пять зим в суровых условиях, либо владел пятью зимними пастбищами.

Суффикс «-ева» указывает на принадлежность: Бескишева — дочь или жена человека по прозвищу Бескиш. Фамилия образована по русской модели, но основа осталась нерусской, что характерно для регионов Поволжья, Приуралья и Южного Урала, где веками жили рядом русские, татары, башкиры и казахи. Носители фамилии, скорее всего, имеют смешанное происхождение или происходят из среды крещёных татар, башкир или казаков, говоривших на тюркских наречиях.

В отличие от многих фамилий, где приходится гадать между именем, профессией и прозвищем, здесь версия с «пятью зимовьями» выглядит самой прямой и правдоподобной. Корень «киш» (зима) встречается в тюркских топонимах и фамилиях (Кишев, Кишаев), а числительное «бес» (пять) — в фамилиях Бесшапошников (не путать с русским «без шапки») или Бесчокров. Бескишева — фамилия, которая буквально «говорит» о быте и счёте зимних стоянок, а не о личном качестве. Поскольку фамилия редкая и не попала в массовые списки дворянства, её носители, скорее всего, были государственными крестьянами, ямщиками или казаками, жившими на границе степной и лесной зон.