Фамилия Боченева — женская форма фамилии Боченев. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Бочень, а оно, скорее всего, связано с бочкой — ёмкостью для хранения жидкостей и сыпучих тел. Прямая аналогия — фамилии Бочкарёв, Бочков, Бочаров. Но суффикс -ень указывает на уменьшительно-ласкательную или пренебрежительную форму: Бочень — это не просто бочка, а маленькая бочка, бочонок, либо человек, получивший такое прозвище за внешность (коренастый, полный, круглый).

Менее очевидная, но возможная версия: Бочень — производное от глагола «бочать» или «бочиться». В диалектах северных и сибирских областей «бочиться» значило упрямиться, уклоняться, сторониться. Тогда Бочень — упрямец, человек, который «бочится», то есть идёт в сторону, не желает делать общее дело. Эта версия объясняет, почему фамилия встречается не только в центральной России, но и на Урале, в Сибири (например, в документах XVII века по Верхотурью есть крестьяне с прозвищем Бочень).

Формант -ев (а не -ов) указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий согласный или на -й. Бочень даёт Боченев — «сын Бочени». Патронимическая модель здесь стандартная, без региональных особенностей.

В сословном отношении Боченевы — почти наверняка крестьянский или посадский род. Фамилия не встречается в столбовых дворянских книгах, не связана с известными боярскими фамилиями. Это фамилия, образованная от бытового прозвища в среде, где прозвища давали по внешности, характеру или занятию.

Стоит заметить, что ударение в фамилии Боченева может колебаться: одни носители ставят ударение на первый слог (Бо́ченева), другие на второй (Боче́нева). Это не ошибка, а следствие того, что исходное прозвище в разных говорах могло произноситься по-разному. Единого литературного ударения для этой фамилии нет.