Фамилия Боданов происходит от прозвища Бодан. Основа здесь — глагол «бодать», который в старину означал не только коровью привычку бить рогами, но и более широкое действие: «толкать или пырять колом, рожном, рогатиной, вилами». В словаре Даля это слово прямо связывают с боем и столкновением.

Судя по такой основе, прозвище Бодан могло попасть к человеку двумя разными путями. Первый — профессиональный: пастух, который отбивался от быков или управлял стадом, погонщик скота, а может, и дрессировщик. Второй — бытовой: так могли прозвать вспыльчивого, задиристого человека, который «лезет в драку» или спорит до хрипоты, словно бодается. Обе версии равноправны, и выбрать одну сложно — прозвища такого типа часто давали и по делу, и по характеру.

Суффикс -ов в фамилии указывает на типичную модель русских отчеств: «чей?» — сын Бодана, то есть Боданов. Таких фамилий в России огромное количество, но Боданов встречается реже, чем, скажем, Бодалов или Бодарев, что делает её более локальной. Географически фамилия чаще фиксируется в южнорусских и центральных областях, особенно в бывших губерниях с активным скотоводством — Тамбовской, Воронежской, Рязанской. Там прозвище Бодан могло быть особенно актуальным.

В ономастических справочниках фамилия не всегда попадает в основные словари, но её корень родственен другим редким фамилиям: Бодановский, Бодановцев. Связь с «боданием» здесь прямая и прозрачная, без тёмных или заимствованных корней.