Фамилия Бодяркин — редкий случай в русской ономастике, где основа, суффикс и ударение работают неочевидно. На первый взгляд, в ней слышится что-то «бодрое» или «бодающее», но это обманчиво. Разберём её по косточкам.

Ключ к фамилии — суффикс -ин. Он указывает на принадлежность: Бодяркин — значит «сын Бодярки» или «человек из семьи Бодярки». Сама основа Бодярк- — это не что иное, как диалектная форма слова «бодяга» (пресноводная губка, которую в народе называли ещё «бодрягой» или «водягой»). В некоторых говорах, особенно в северных и центральных губерниях, звук «г» перед «а» мог переходить в «к»: бодяга — бодяка. Отсюда и прозвище Бодярка — так могли назвать человека, который торговал бодягой, собирал её или жил у водоёма, где она водилась. Бодягу в старину использовали в народной медицине, для натираний и как средство от синяков — промысел был не таким уж редким.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с глаголом «бодать» (бодаться). В этом случае Бодярка — прозвище бодливого, упрямого человека, которого сравнивали с быком. Однако против этой гипотезы говорит суффикс -ярк-, а не -як-. Форма «Бодяк» (от бодать) встречается в фамилиях Бодяков, Бодягин, а вот «Бодярка» — скорее производное от названия предмета, чем от действия.

Фамилия Бодяркин — локальная. Она почти не встречается в центральных регионах, зато фиксируется в старых документах по Архангельской и Вологодской губерниям. Именно там, в бассейне Северной Двины и её притоков, бодяга была обычным подручным средством, и прозвища от неё давали без затей. Носитель фамилии в XVII–XVIII веках, скорее всего, был крестьянином или промысловиком, а не дворянином: фамилии на -ин от прозвищ на -ка — типичная крестьянская модель, особенно на Русском Севере.

В написании фамилии стоит обратить внимание на ударение. В большинстве говоров оно падает на последний слог — Бодярки́н. Если произносить с ударением на «я» (Бодя́ркин), фамилия звучит как вариант от имени «Бодя» (гипокористика от Богдан или Борис), но тогда суффикс был бы -ин с иной огласовкой основы. Современные носители фамилии разбросаны по России негусто, и в каждом конкретном случае стоит проверять местные архивы — именно там, в писцовых книгах, может открыться точное значение.