Фамилия Боглачева — женская форма, а её мужской вариант Боглачев. Это относительно редкая фамилия, и её происхождение напрямую связано с прозвищем, которое давали человеку с характерной внешностью или особым говором.

В основе фамилии лежит слово «боглай» или «боглый». В южнорусских и украинских говорах так называли человека с большими, навыкате или «дикими» глазами. Слово имеет тюркские корни (сравните с татарским «баклай» — «глядеть», «таращиться»). Прозвище Боглай, скорее всего, закрепилось за тем, кто отличался широко распахнутыми, выразительными глазами, возможно, от природы пучеглазым.

Суффикс -ев в фамилии указывает на притяжательное значение: Боглачев — это «сын Боглая» или «человек из рода Боглая». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ, оканчивающихся на согласный. Важно, что в написании фамилии встречается вариант через «а» — Боглачёв, но ударение в любом случае падает на второй слог (Богла́чев).

Встречается фамилия преимущественно в центральных и южных областях России, а также среди потомков казачества, где прозвища по внешним признакам были особенно распространены. В дореволюционных переписях носители фамилии фиксировались как крестьяне и мещане. Никакой связи с богом или богословием в фамилии нет — этимология сугубо бытовая, описательная.