Фамилия Богуля — редкий пример, где прозвище образовано не от имени человека, а напрямую от слова «бог». В отличие от огромного пласта фамилий на -ов/-ев, где основа — крестильное имя (Богдан, Борис), здесь мы видим суффикс -ул(я), который в русских говорах придаёт слову ласкательный или уменьшительный оттенок. То есть Богуля — это буквально «боженька», «божок», но не в смысле идола, а как ласковое обращение или прозвище.

Самый вероятный путь появления фамилии — через мирское имя-оберег. В дохристианской и раннехристианской традиции родители могли назвать ребёнка Богулей, чтобы подчеркнуть: дитя отдано под защиту высших сил, оно «божье». Такие имена (Боган, Божко, Богухвал) встречаются в древнерусских грамотах, и Богуля — их уменьшительная форма. Позже прозвище закрепилось за главой семьи и перешло к детям без изменений, как это свойственно украинской и южнорусской модели (сравните: Голота, Непейвода).

Вторая, менее распространённая, но тоже возможная версия — связь с глаголом «богулить» или диалектным «боговать». В некоторых говорах это означало «побираться», «просить милостыню» (от «бога ради»). Тогда Богуля — прозвище нищего или человека, который постоянно клянчит. Однако эта версия слабее: суффикс -ул(я) обычно образует не прозвища по действию, а ласкательные формы имён или названия живых существ (козуля, канюля).

Географически фамилия тяготеет к западу и югу — чаще всего её корни ищут на Украине, в Белоруссии и в пограничных областях России. Встречается она и у поляков (Bogula), где могла возникнуть независимо от того же корня. В польской ономастике Богуля — это также сокращение от сложных имён типа Богумил или Богдан, с тем же уменьшительным суффиксом.

Интересная деталь: фамилия Богуля стоит в одном ряду с такими же «божескими» прозвищами, как Божко, Божок, Боговин. Но если Божко — типичная украинская форма, то Богуля звучит более архаично и реже. Носители этой фамилии, скорее всего, потомки людей, которых в XVI–XVII веках в документах записали по прозвищу, а не по отчеству — что говорит о непривилегированном, крестьянском или казачьем происхождении.