Фамилия Боканова — женская форма, а её мужской вариант, Боканов, образован по стандартной для русских фамилий модели: к основе добавили суффикс -ов. Это значит, что в основе лежало прозвище или мирское имя предка — Бокан. Вопрос в том, что именно означало это слово.

Здесь есть две основные версии, и обе опираются на говорящие прозвища. Первая связывает Бокана с диалектным словом «бокан» — так в некоторых русских говорах называли бортник, человека, добывающего мед диких пчел. Если предок занимался лесным пчеловодством, его легко могли прозвать Боканом, а потом и фамилия закрепилась за его детьми. Вторая версия отсылает к «боку»: боканом или бокастым в народе называли человека широкоплечего, плотного, с мощной фигурой. Прозвища по внешности давали часто, и такая этимология тоже вполне правдоподобна.

Менее вероятна, но не исключена связь с тюркскими корнями, где «бокан» могло означать что-то вроде «бык» или «упрямец». Однако для фамилий центральной России, где фамилия Боканова встречается нередко (особенно в Поволжье и на юге), славянская основа — основная.

Суффикс -ов указывает на то, что фамилия сформировалась как притяжательное прилагательное: «чей сын?» — Боканов. Это типичная модель для крестьянских и мещанских фамилий XVII–XIX веков, когда прозвище главы семьи переходило к детям без изменений. В архивах можно найти упоминания крестьян Бокановых в Тамбовской и Рязанской губерниях, что подтверждает связь с земледельческим и промысловым бытом.

Таким образом, предки современных Бокановых — скорее всего, или люди недюжинной комплекции, или лесные пчеловоды, оставившие свой след в языке и в фамилии.