Фамилия Болдырев образована от прозвища Болдырь. В основе лежит нарицательное «болдырь», которое имеет значение «животное, происшедшее от смеси двух видов или пород», а в переносном смысле — «выродок». Скорее всего, родоначальник Болдыревых родился от представителей двух разных племен, например, русского и калмыцкого, монгольского или татарского. Такое прозвище давали человеку, в чьей внешности или характере видели смешение разных кровей.

Типичная модель образования: к основе «Болдырь» добавили притяжательный суффикс -ев, который указывал на принадлежность к главе семьи. Так, сын Болдыря становился Болдыревым. Это один из самых распространенных способов формирования русских фамилий, особенно в центральных и южных регионах.

В истории известен дворянский род Болдыревых. Его начало ведут от Артемия и его сына Федора, которых в начале XVII века верстали поместьями в Ростовском уезде. Правнуки Федора Артемьевича — Гавриил, Давид и Матвей Васильевичи — утверждены Герольдией в древнем дворянстве со внесением в первую часть родословной книги Ярославской губернии, так как представили самый древний документ от 1695 года. Этот факт подтверждает, что к концу XVII века фамилия уже прочно закрепилась за конкретной ветвью.

О точном месте и времени возникновения фамилии Болдырев говорить сложно: процесс формирования фамилий был длительным. Но в любом случае, потомок человека с прозвищем Болдырь со временем получил фамилию, которая стала наследственным родовым именем.