Фамилия Болонихин — редкий случай, когда этимология может увести в две совершенно разные стороны: географическую и прозвищную. И у каждой версии есть своя логика.

Первая гипотеза связывает фамилию с гидронимом Болонь — озером в Хабаровском крае. Если это так, то предок Болонихин получил прозвище по месту жительства: его называли Болоня или Болониха, то есть «житель с озера Болонь». Такая модель образования фамилий от названий рек и озёр (с суффиксом -ихин) встречается в северных и сибирских говорах, где люди часто идентифицировали себя по урочищу или водоёму.

Вторая версия сложнее и интереснее. Она отталкивается от прозвища Болониха, которое образовано от слова «болона». В древнерусском языке «болона» означало несколько вещей: оболочку, плёнку; голову палицы (утолщение на конце дубины); брюшную часть говядины; а также приставной зимний ставень, обитый войлоком для тепла. Такая многозначность слова даёт простор для реконструкции характера или занятия предка.

Если прозвище отражало характер, то Болоняхой могли назвать человека замкнутого, «оболочечного», необщительного — как бы закованного в свою скорлупу. Или, наоборот, осторожного, робкого, прячущегося за «ставнями». Если же прозвище указывало на ремесло, то предок мог быть воином (бил палицей), мясником (разделывал туши) или строителем (мастерил ставни). В любом случае, прозвище закрепилось за одним человеком, а его дети и внуки стали Болоникиными — по типичной для русских фамилий модели «чей?»: сын Болонихи.

Обратите внимание на суффикс -ихин. Он характерен для фамилий, образованных от прозвищ на -иха (Болониха, Пимиха, Мелиха). Такие фамилии особенно распространены в северных и центральных областях России. Это указывает на то, что предок Болоникиных, скорее всего, жил именно в этих краях, а не на Дальнем Востоке у озера Болонь. Поэтому вторая версия — от прозвища — выглядит более правдоподобной для большинства носителей фамилии.

Итог: Болонихин — фамилия, которая с большой вероятностью произошла от прозвища Болониха, данного по занятию или черте характера. Связь с озером Болонь возможна, но маловероятна для массового бытования фамилии.