Фамилия Болонихин восходит к гидрониму Болонь — озеро в России, в Хабаровском крае. Согласно другой гипотезе, фамилия Болонихин образована от прозвища Болониха, основой для которого послужило нарицательное «болона» - «оболочка», «голова палицы», «брюшная часть говядины», «приставной зимний ставень для тепла, иногда обитый войлоком». Вероятно, прозвище либо отражало особенности характера и поведение предка (малообщительный, осторожный, робкий), либо содержало указание на род его деятельности (воин, мясник, строитель, мастер по изготовлению окон). Исходя из этого можно предположить, что предок Болонихиных жил в подобной местности. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Болониха, со временем получил фамилию Болонихин.