Фамилия Болонин образована от прозвища Болон. В его основе лежит нарицательное «болона», т.е. «оболочка». Другие значения этого слова — «опухоль», «голова палицы». Скорее всего, Болоном могли называть либо замкнутого, необщительного человека, любящего уединение, либо больного, либо того, кто изготавливал палицы. Возможно также, что в основу прозвища легло слово «болонка», которое в псковских, смоленских и курских говорах означает «приставной зимний ставень для тепла, иногда обитый войлоком; щит, заслон». В таком случае прозвище Болон относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на род занятий человека. Кроме того, на Руси болоньем называли слободу, околицу, а также низменную луговую равнину у реки или озера. Исходя из этого можно предположить, что предок обладателя фамилии Болонин жил в подобной местности. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Болон, со временем получил фамилию Болонин.