Фамилия Болонин — типичный пример русской фамилии на -ин, которая образовалась от прозвища или имени Болон. Такая модель указывает на принадлежность: «чей?» — «Болонов сын», то есть потомок Болона.

Что скрывается за этим прозвищем? Слово «болона» в древнерусском языке означало «оболочка», «плёнка», «перепонка». В народных говорах у него развились и другие значения: «опухоль», «нарост», а также «голова палицы» — утолщение на конце дубины. Поэтому прозвище Болон могло достаться человеку с каким-то физическим недостатком (опухолью), либо замкнутому, «оболоченному» от мира, либо, напротив, мастеру, делавшему палицы.

Есть и менее очевидная версия, связанная с диалектным словом «болонка». В псковских, смоленских и курских говорах так называли приставной зимний ставень, щит, которым закрывали окно от холода. Прозвище Болон в этом случае мог получить плотник или просто человек, занимавшийся изготовлением таких ставней. Это уже указание на ремесло, а не на внешность или характер.

Третья возможность связана с географией. На Руси «болоньем» (или «болоном») называли слободу, предместье, а также низменную пойменную луговую равнину у реки или озера. Житель такого места — «болонянин» — вполне мог получить прозвище Болон, которое затем перешло в фамилию. Эта версия особенно правдоподобна для северных и центральных русских областей, где слово «болонь» в значении «заливной луг» было широко распространено.

Какую из этих версий считать основной? Скорее всего, фамилия возникла в среде, где слово «болона» бытовало в бытовом смысле — как «оболочка» или «нарост». Прозвища по внешним признакам давали чаще, чем по редкому ремеслу или месту жительства. Но исключать «ставенную» и «луговую» версии нельзя: язык не терпит однозначности, и у фамилии Болонин, как у многих старых русских фамилий, скорее всего, несколько корней, которые сошлись в одном звучании.