Фамилия Борковская — типичный пример фамилии, образованной от географического названия. Её основа — топоним Борково, а суффикс -ск- указывает на дворянское или шляхетское происхождение, хотя со временем такие фамилии распространились и среди других сословий. Деревень с названием Борково на карте России, Украины и Белоруссии десятки. Одна из них стоит на берегу реки Вязьма в Смоленской области. Предок, получивший фамилию Борковский, скорее всего, был выходцем именно из такого селения — владельцем или жителем Боркова.

Есть и другая версия, менее распространённая, но не менее интересная. Она отталкивается от прозвища Борковый. В старых русских говорах «борк» означало ствол, дудку или очин пера — ту часть гусиного пера, которой писали. Если предок был писцом, его могли прозвать Борковым, а потомки уже получили фамилию на -ский. В украинском и белорусском языках есть слово «боркан» — морковь. Тогда прозвище могло указывать на огородника, торговавшего морковью. Обе гипотезы связывают фамилию с конкретным занятием человека, хотя топонимическое объяснение выглядит убедительнее: фамилий на -ский, образованных от названий сёл, в этой части Европы большинство.