Фамилия Борковский — типичный пример «топонимической» фамилии, то есть образованной от названия места. Чаще всего её давали людям, которые переселились из какой-нибудь деревни Борково. Таких деревень много на западе России, в Белоруссии и на Украине — например, Борково в Смоленской области, стоящее на реке Вязьма. Владелец поместья с таким названием тоже мог получить фамилию по своему имению, поэтому дворянские роды Борковских встречаются в польско-литовской шляхте.

Однако не всё так однозначно. В основе фамилии лежит корень «борк», который в русских говорах означал «ствол», «дудка» или «очин пера» (та часть гусиного пера, которой писали). Отсюда — версия, что прозвище Борковый могли дать писцу или переписчику книг. Это редкое, но логичное объяснение: профессиональные прозвища нередко превращались в фамилии на -ский, хотя модель «ремесло + -ский» для восточнославянских фамилий менее типична, чем для польских.

Есть и третья гипотеза: от слова «боркан» — так в некоторых диалектах называли морковь. Тогда Борковым могли прозвать огородника, торговавшего морковью. Эта версия правдоподобна, но менее убедительна, чем топонимическая: фамилии на -ский в подавляющем большинстве случаев указывают на географическое происхождение, а не на занятие.

Суффикс -ский в фамилии Борковский говорит о том, что её носители, скорее всего, относились к шляхте или духовенству. В простонародье такие фамилии закрепились реже — там преобладали патронимы на -ов/-ев или -ин. Поэтому можно предположить, что предки Борковских были либо мелкими землевладельцами, либо священниками, получившими фамилию по названию своего прихода.