Фамилия Боркуновы (в мужском варианте — Боркунов) образована от личного прозвища Боркун. В русской ономастике это типичная патронимическая модель: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — сын Боркуна), поэтому основная масса носителей этой фамилии — потомки одного человека, которого в быту прозвали Боркун.

Что стояло за этим прозвищем — вопрос с несколькими вариантами ответа. Первая версия ведет к диалектному слову «борк», которое в западных говорах означало «стебло, ствол, дудка или очин пера». Если так, то Боркун мог быть писцом — человеком, работавшим с перьями и бумагой. Вторая версия опирается на глагол «боркать» — стучать, бренчать, а также бормотать или ворчать. Отсюда два возможных образа: либо ремесленник, создающий шум (плотник, лесоруб, музыкант), либо человек с неспокойным, вспыльчивым нравом, который постоянно бурчит.

Третья, менее очевидная гипотеза, связывает прозвище с диалектным словом «боркан» — морковь. В этом случае Боркуном могли прозвать огородника, который выращивал морковь на продажу. Сравните с однокоренными фамилиями Борков, Борканов — они встречаются реже, но подтверждают, что основа «борк-» в русских говорах имела несколько значений, не связанных друг с другом.

Из-за многозначности исходного слова точно определить, кем был первый Боркун, сложно. Но сама фамилия — живой след народной речи, где одно прозвище могло закрепиться и за писцом, и за ворчуном, и за торговцем морковью. Фамилия Боркунов встречается в разных регионах, но особенно часто — в областях, где были распространены западные и южнорусские говоры, что делает её интересным памятником диалектной лексики и славянской культуры.