Фамилия Борнягина — женская форма от Борнягин, а её основа, скорее всего, связана не с дворянским родом или книжным именем, а с бытовым прозвищем или профессией. Разберёмся по порядку.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Борнягин — сын или потомок Борняги. Само прозвище Борняга образовано от корня «борн-», который в русских говорах имел несколько значений. Самое вероятное — «борона» или «бороньба» (вспашка). Борнягой могли назвать крестьянина, который занимался боронованием, или человека с тяжёлым, «скребущим» характером.

Вторая версия, менее распространённая, но тоже имеющая право на существование: связь с диалектным словом «борня» — так в некоторых областях называли драку, ссору или шум. В этом случае Борняга — прозвище задиры или скандалиста. Однако первая версия выглядит правдоподобнее: фамилии от сельскохозяйственных орудий и действий (Плужников, Серпов, Косцов) встречаются гораздо чаще, чем от абстрактных понятий.

Географически фамилия Борнягин (и Борнягина) тяготеет к центральным и северным регионам России, особенно к бывшим Вологодской и Архангельской губерниям. Там слово «борона» было в ходу, а прозвища от ремёсел закреплялись особенно прочно. Встречаются однокоренные фамилии — Борняков, Борноволоков, Борнов — что подтверждает связь с земледелием.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые могли давать по имени отца (Иван — Иванов), суффикс -ин чаще указывал на прозвище или занятие. Поэтому Борнягины в большинстве своём — потомки крестьян или ремесленников, чей предок был известен как Борняга, то есть пахарь с бороной. Это не делает фамилию редкой или аристократической, но даёт чёткую привязку к русскому северному быту.