Фамилия Бороган — один из тех редких случаев, когда внешне славянская форма скрывает неславянскую основу. На слух она кажется типичной для южнорусских или украинских фамилий с суффиксом -ан (как Ждан, Борщан), но её корень, скорее всего, тюркский.

Наиболее вероятное объяснение: в основе лежит тюркское слово «бурун» или «борун» — «нос». В переносном смысле так могли прозвать человека с заметным, крупным или необычным носом. Тюркские прозвища по внешним чертам (Кара — «чёрный», Кочкар — «баран») были распространены у народов Поволжья, Приуралья и южнорусских степей. Вариант «Бороган» мог возникнуть из «Бурунган» через обмен гласных или как адаптация к местному говору.

Версия со славянским корнем «бор» (сосновый лес) или «бороть» (бороться) маловероятна: суффикс -оган нехарактерен для русского словообразования. Нет в русском языке и слова «борог» или «борога», от которого логично образовать такую фамилию.

Географически фамилия Бороган встречается рассеянно, без плотного гнезда, что говорит о её позднем закреплении и возможном смешении этносов. Носители могли быть выходцами из казачьих областей, где тюркские заимствования в прозвищах — обычное дело.

Примечательна и модель образования: суффикс -ан часто указывал на человека, обладающего признаком, названным в корне. То есть Бороган — это «носатый», «тот, у кого нос». Такие прозвища давали без злого умысла, по яркой внешней примете.