Фамилия Бороздун — редкий пример, где основа сохранила почти неизменным древнее слово, а не адаптировала его под более привычные модели. В отличие от массовых Бороздиных и Бороздных, этот вариант застыл в форме прозвища, которое так и не «обрусело» до типового суффикса -ов.

Корень здесь — «борозд-», от слова «борозда». Но прозвище Бороздун вряд ли дали землепашцу. В говорах «бороздуном» называли не того, кто пашет, а того, кто «бороздит» — то есть ходит взад-вперед, суетится без толку, или же, наоборот, делает глубокие, неровные движения. В псковских и тверских диалектах «бороздун» — это ещё и неуклюжий, неловкий человек, который постоянно обо что-то спотыкается или «чертит» землю ногами. Таким образом, фамилия скорее уходит в мир бытовых характеристик, а не в сельскохозяйственный труд.

Суффикс -ун в русских прозвищах — типичный признак деятеля по характерному действию (ворчун, молчун, бегун). Бороздун — «тот, кто бороздит», причём с оттенком постоянства или привычки. Такие прозвища не были фамилиями в современном смысле: их давали в деревне одному человеку, и они редко закреплялись за родом, если не переходили в фамилию через документальную фиксацию. Бороздун как раз мог остаться прозвищем без патронимического суффикса — явление редкое, но встречающееся в северных и сибирских регионах, где поздно утвердилась обязательная трёхчленная формула имени.

Географически фамилия привязана к Русскому Северу и Вологодчине. В переписных книгах XVII века встречаются крестьяне с прозвищем Бороздун в Шенкурском и Каргопольском уездах. Там же фиксируется и вариант Бороздунов — уже с суффиксом принадлежности. Сам Бороздун без наращения — архаичная форма, сохранившаяся у староверов или в глухих деревнях, где документы писали «как слышали».

Вторая версия, менее вероятная, но не отбрасываемая полностью, — связь с диалектным «борозда» в значении «морщина, складка». Тогда Бороздун — «морщинистый, сморщенный человек». Однако для такого значения чаще использовали слово «бороздач» или «бороздник», так что версия с «бороздить» (ходить, мешать, неуклюже двигаться) выглядит убедительнее.

Фамилия не получила широкого распространения. В современных базах данных она встречается единично — в основном в Архангельской области и у потомков северных переселенцев в Сибири. Это не аристократическая и не купеческая фамилия, а чисто крестьянское прозвище, которое чудом не стёрлось в череде поколений.