Фамилия Борухин — один из тех случаев, где корень указывает на этническое и религиозное происхождение предка напрямую. В основе лежит мужское личное имя Борух — это еврейская форма библейского имени Барух (ивр. ברוך, «благословенный»). В русской бытовой и документальной среде XIX века имя записывали на слух: Борух, реже — Барух. Соответственно, Борухин — это «сын Боруха» или «человек из семьи Боруха».

Суффикс -ин указывает на типичную восточнославянскую модель образования фамилий от основ, оканчивающихся на согласный. Интересно, что для еврейских фамилий в черте оседлости (территории современных Украины, Беларуси, Молдовы и части Польши) такая модель была распространена: её давали при переписях и в рекрутских списках, адаптируя имя отца к русскому патронимическому шаблону. Так рядом с Борухиными появлялись Абрамкины, Янкелевы, Хаимовы.

Можно встретить и другую версию: что фамилия произошла от прозвища Боруха — якобы от древнерусского глагола «борухать» (шуметь, ворчать). Но эта гипотеза слабая: такого слова в памятниках письменности не зафиксировано, а имя Борух как основа встречается в метрических книгах гораздо чаще, чем любое прозвище. Поэтому версия с библейским именем — основная и наиболее правдоподобная.

Географически фамилия Борухин тяготеет к юго-западным регионам Российской империи: Подольская, Волынская, Киевская губернии. После революции и в ходе миграций XX века носители разъехались по всей стране, но исходный ареал — территория бывшей черты оседлости. Сословно предки Борухиных были, скорее всего, мещанами или купцами — среди крестьян-земледельцев еврейские фамилии встречались реже.

В написании стоит обратить внимание на вариант Борухин — с ударением на второй слог (БорУхин), хотя в разговорной речи иногда смещают на первый. Это не ошибка, а диалектное или семейное произношение. В дореволюционных документах фамилия могла писаться через «а» — Барухин, но в современном русском языке закрепилась форма с «о» как более привычная для слуха.