Фамилия Ботой, предположительно, образована от аналогичного имени, которое в переводе с тюркского означает «верблюжонок». В Киргизии верблюд считается животным-кормильцем, незаменимым помощником в хозяйстве, а слово «верблюжонок» употребляется по отношению к человеку как ласкательное прозвище. Оно берет начало от нарицательного «ботой», которое в некоторых тюркских языках (в частности в киргизском) означает «быть смирным, кротким, скромным, послушным». Вполне вероятно, что прозвище Ботой указывало на особенности характера его носителя. Так могли назвать спокойного и уравновешенного человека. Тюркский корень -огло/-оглу/-оглы (в переводе «потомок, сын») типичен для турецких, гагаузских и прочих тюркских фамилий.