Фамилия Бовтунов — один из тех случаев, когда за привычным русским окончанием скрывается нерусская основа. Сама фамилия звучит по-славянски, но корень «бовтун» в русском языке не встречается. Если отбросить суффикс -ов (указывающий на принадлежность: «чей?» — Бовтунов, то есть сын Бовтуна), остаётся прозвище Бовтун. Вот с ним и надо разбираться.

Самая вероятная версия выводит прозвище из украинского или южнорусского диалекта. В украинском языке «бовтати» означает «болтать, взбалтывать, плескать». Отсюда «бовтун» — человек, который болтает ногами, суетится, или, в переносном смысле, пустомеля, говорун. Фамилия могла закрепиться за тем, кто много и попусту говорил, «болтал языком». Вторая, более прозаичная трактовка — прозвище по действию: например, работник, который «бовтает» что-то в чане (красильщик, кожевник, пивовар). Такие профессиональные прозвища были обычным делом.

Менее убедительной выглядит попытка связать «бовтун» с тюркским «байтун» (богатый, знатный). Для этого пришлось бы допустить сложное фонетическое изменение, которое не находит подтверждения в истории фамилии. География распространения тоже говорит в пользу славянской версии: фамилия Бовтунов встречается преимущественно в южных регионах России, на Кубани, в Ростовской области — то есть там, где сильны украинские диалектные влияния. Это косвенно подтверждает, что предок носителя фамилии был выходцем с Украины или юга России, где «бовтун» было понятным словом.

Обратите внимание на суффикс -ун-. В русских фамилиях он часто образует прозвища по характерному действию или свойству: говорун, бегун, ворчун. Бовтун встаёт в этот же ряд. Модель образования типична: прозвище на -ун → отчество с суффиксом -ов → фамилия. Никакой аристократии или дворянства за этой фамилией не числится — это чисто крестьянская или казачья фамилия, возникшая в среде простых людей, где прозвище давали метко и навсегда.