Фамилия Боженаров — редкий случай, когда основа, на первый взгляд, прозрачна, но на деле ставит перед исследователем выбор между двумя совершенно разными корнями. В ней отчетливо слышится что-то «божье» или «божье», и это не случайно.

Первый и самый очевидный вариант — происхождение от имени Боженар. Это западнославянская (польская, чешская) или южнославянская форма имени, родственного русскому Богдан. Боженар — буквально «божий дар», «данный Богом». В этом случае фамилия Боженаров — типичная патронимическая модель на -ов, означающая «сын Боженара». Такое объяснение поддерживается тем, что на Руси фамилии с основой «Божен-» встречаются, но чаще в формах Боженов, Боженков. Форма Боженаров с суффиксом -ар указывает на возможное польское или украинское влияние: в польском языке суффикс -arz (Боженарж) часто образовывал имена деятеля, а в украинском — фамилии с -ар встречаются реже, но возможны.

Вторая версия, более прозаичная, но не менее вероятная, — профессиональное прозвище. В южнорусских и украинских говорах «боженар» или «боженарь» могло означать человека, который делал «божницы» — киоты для икон, или же занимался писанием икон (божник). Если предок был богомазом или резчиком по дереву, делавшим оклады и киоты, его могли прозвать Боженар. Отсюда и фамилия: «Боженаров» — сын Боженара, то есть сын мастера по божницам.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где пересекались русские и украинские говоры, а также к территориям, испытавшим влияние Речи Посполитой. Встречается она нечасто, что говорит о локальном бытовании прозвища или имени. Суффикс -ов здесь указывает на великорусское оформление фамилии, но основа выдает западно- или южнорусские корни носителя.

Таким образом, Боженаровы — потомки либо человека с «говорящим» именем Боженар (редкий вариант Богдана), либо мастера, связанного с церковным обиходом. Оба корня ведут к одному смысловому полю — к Богу, но разными путями: через имя и через ремесло.