Фамилия Боженец — редкий пример фамилии, образованной не от имени или профессии, а от отвлечённого понятия с суффиксом, типичным для западнославянских языков. В русском ономастиконе такие модели встречаются нечасто, и именно это делает фамилию интересной для разбора.

Основа фамилии — «бож-», восходящая к слову «бог». Суффикс «-енец» (в польском, белорусском и украинском вариантах) указывает на лицо по признаку или месту: ср. «варшавянец», «львовянец». В случае с Боженцем это могло означать «человек, относящийся к Богу» — не в прямом смысле священнослужителя, а скорее как прозвище богомольного, набожного человека или того, кто часто упоминал Бога в речи. В польском языке существует слово «bożec» (божок, идол), но суффикс «-енец» указывает на более сложную модель — возможно, от названия поселения вроде Боженец или Боженице, которые встречаются в исторических землях Польши и Беларуси.

Фамилия могла возникнуть в западнорусских землях (современные Беларусь, Украина, западные области России) в XVI–XVII веках, когда суффикс «-енец» активно использовался для обозначения выходцев из определённой местности. Если предок носителя фамилии происходил из деревни с названием, связанным с корнем «бож-», то Боженец — это указание на его географическое происхождение. Альтернативная версия — отчество от прозвища Боженец, которое давали человеку, родившемуся в религиозный праздник или отличавшемуся особой верой.

В отличие от распространённых фамилий на «-ов» или «-ин», Боженец сохранил архаичную словообразовательную форму, которая почти не встречается в центральной России. Это типичная фамилия для регионов, где сильны польские и белорусские ономастические традиции. В современных переписях она единична, что говорит о её локальном бытовании и, вероятно, узком круге родственных линий.