Фамилия Божина образована от прозвища Божин, которое, скорее всего, дали набожному и благочестивому человеку. В основе прозвища лежит глагол «божиться» — то есть «молиться», «клясться именем Бога». Потомок такого человека со временем закрепил за собой фамилию Божина.

По словообразовательной модели фамилия относится к самому распространённому в русской ономастике типу — «патронимическим» фамилиям на -ин. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Божина, то есть сын Божина. Такая модель характерна для фамилий, образованных от основ на -а/-я, и в этом смысле Божина стоит в одном ряду с фамилиями вроде Ильина, Фомина или Кузьмина.

Менее вероятна, но допустима и другая версия: прозвище Божин могло быть связано не с действием, а с именем. В древнерусских говорах иногда встречалось личное имя Божа, Божко — уменьшительная форма от Богдан или Борис. Если это так, то фамилия Божина — это «сын Божи» или «сын Божко», и её первоначальный смысл теряет прямую связь с благочестием, переходя в разряд «вотчинных» прозвищ.

Географически фамилия Божина встречается в основном в центральных и южных регионах России, а также в Беларуси и на Украине. В дореволюционных переписях она фиксировалась преимущественно среди крестьян и мещан, что типично для фамилий, образованных от прозвищ, а не от канонических церковных имён. Интересно, что в некоторых южнорусских говорах слово «божина» могло означать «церковная земля» или «божий дар», но это значение скорее случайное совпадение, чем источник фамилии — прозвище Божин явно первично.

В итоге, независимо от того, как именно возникло прозвище — от религиозного поведения или от краткой формы имени, — фамилия Божина сохраняет в своей основе образ человека, так или иначе связанного с понятием «Бог». Это не делает её уникальной среди тысяч русских фамилий, но придаёт ей ясную и прозрачную этимологию.