Фамилия Бударков образована по самой распространённой в русском языке модели: от прозвища или имени на -а, -я с помощью патронимического суффикса -ов (Бударк → Бударков). Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Буда́рков. Основа фамилии — «буда́рка» или «буда́рк(а)».

В русских говорах, особенно южных и донских, «бударкой» называли небольшую лодку-долблёнку, иногда с наращенными бортами. На Дону и Волге бударки использовали для рыбной ловли и перевоза грузов. Человек, который делал такие лодки, владел ими или постоянно на них плавал, мог получить прозвище Бударка. Со временем оно закрепилось за детьми и внуками как фамилия. Эта версия — основная и наиболее прозрачная.

Есть и другая возможность, хотя и менее вероятная. В некоторых диалектах «бударить» означало «стучать, колотить, громыхать». Тогда Бударкой могли прозвать шумного, суетливого человека или того, кто работал с грохотом — например, кузнеца. Однако связь с лодкой выглядит убедительнее: географически фамилия чаще встречается в регионах, где был развит речной промысел (Поволжье, Дон, Приднепровье).

Фамилия сравнительно редкая. Она не попала в число массовых дворянских или купеческих родов, что указывает на крестьянское или казачье происхождение. В ревизских сказках XIX века Бударковы фигурируют в основном как государственные крестьяне и казаки Войска Донского. Интересная деталь: в некоторых переписях фамилия писалась через «о» — Бодарков, что связано с акающим произношением (Бударка произносили как Бударка, но на письме могли ошибиться). Такие варианты стоит учитывать при поиске предков.

Однокоренных фамилий немного: Бударёв (от «бударь» — лодочник), Бударин. Но Бударков стоит особняком именно из-за суффикса -к-, который придаёт прозвищу уменьшительный или пренебрежительный оттенок — «маленькая лодочка» или «лодчонка». Это не ремесленное именование, а скорее бытовое, уличное.