Фамилия Бударкова — женская форма фамилии Бударков. Её основа — прозвище или нецерковное имя Бударок. В русских говорах, особенно южных и донских, «бударка» — это небольшая плоскодонная лодка-долблёнка, а также лодка-однодеревка, выдолбленная из цельного ствола дерева. Человек, которого прозвали Бударком, мог быть лодочником, перевозчиком или тем, кто делал такие лодки. Слово «будара» (или «бударка») восходит к тюркским языкам, где обозначало баржу или речное судно, и закрепилось в донских и волжских говорах.

По другой, менее вероятной версии, в основе лежит диалектный глагол «бударить» — стучать, колотить, греметь. Тогда Бударок — прозвище шумного, неспокойного человека или того, кто работает с грохотом (например, кузнеца). Но связь с лодкой кажется более прямой и правдоподобной, особенно если учесть, что фамилия распространена в регионах, где развито речное судоходство: на Дону, в Поволжье, на Урале.

Модель образования проста: к основе «Бударок» добавили патронимический суффикс -ов, что дало фамилию Бударков. Форма Бударкова — это указание на жену или дочь Бударкова, по старой русской традиции. Фамилия не относится к числу частых, но встречается в документах XVII–XVIII веков, например, среди служилых людей и крестьян южных уездов России.

Ударение в фамилии чаще всего падает на второй слог — Буда́ркова, хотя в некоторых говорах могут произносить с ударением на последний слог. Встречаются однокоренные варианты: Бударин, Бударев, Бударный, но Бударкова стоит несколько особняком из-за редкой для русских фамилий основы — названия лодки.