Фамилия Бударникова — женская форма фамилии Бударников, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или профессией предка по мужской линии. Основа здесь — слово «бударник» или «бударь», и сразу возникает несколько версий, из которых одна выглядит убедительнее других.

Самая вероятная версия отсылает к слову «бударка» — так в южных и центральных областях России, особенно на Дону и Волге, называли небольшую рыбацкую лодку-долблёнку или плоскодонку. Соответственно, «бударник» — это владелец такой лодки или рыбак, работавший на ней. Фамилия, таким образом, профессиональная: предок был речником, рыбаком или перевозчиком. В пользу этой версии говорит и география: фамилия Бударниковы встречается в Волгоградской, Ростовской, Астраханской областях, то есть в местах развитого речного промысла.

Вторая, менее распространённая гипотеза связывает фамилию с диалектным глаголом «бударить» — стучать, колотить, греметь. В этом случае прозвище Бударник могли дать шумному, неспокойному человеку, любителю пошуметь. Однако такая версия не объясняет суффикс -ник, который чаще указывает на деятеля или владельца, а не на качество характера.

Суффикс -ников типичен для русских фамилий, образованных от названий профессий или предметов (ср. Кожевников, Плотников, Свечников). Форма Бударникова — притяжательное прилагательное, отвечающее на вопрос «чья?»: жена или дочь Бударникова. Интересно, что в некоторых говорах «бударником» могли называть не только рыбака, но и работника, который «бударил» — то есть глушил рыбу специальным шестом, что опять же возвращает нас к рыболовству.

В архивных записях фамилия фиксируется с XIX века, преимущественно в казачьих областях. Носители фамилии Бударниковы не принадлежали к дворянству — это фамилия крестьян, казаков и мещан, что подтверждается и её «ремесленной» основой. Сегодня фамилия встречается нечасто, но сохраняет прямой след занятия, которое кормило предков.