Фамилия Будилин — один из тех случаев, когда за привычным окончанием -ин скрывается не просто прозвище, а целая должность. Основа фамилии — слово «будила». В старину так называли человека, который будил людей на работу: в городах и сёлах, на постоялых дворах или при монастырях были специальные сторожа, ходившие с колотушкой или криком. Это не случайная черта характера, а конкретная обязанность — своего рода «профессиональная фамилия» до того, как она стала наследственной.

В нижегородских говорах у слова «будила» было и другое значение — безбородый мужчина. Возможно, прозвище закрепилось за человеком с такой внешностью, и тогда фамилия Будилин по смыслу оказывается неожиданно близка к фамилиям вроде Безбородов или Голобородько, но с местным диалектным оттенком.

Есть и третья, более редкая версия: «Будила» могло быть сокращением от древнерусских двусоставных имён Будимир или Будислав. Такие имена были популярны в домонгольской Руси, а их краткие формы (Будила, Будило) позже перешли в прозвища. В этом случае фамилия Будилин — отголосок древней славянской традиции имянаречения, а не просто бытового прозвища.

Историк С. Б. Веселовский в своих работах по ономастике упоминает однокоренную фамилию Будило, носителем которой был подьячий, казнённый в 1570 году в опричнину. Эта запись — одно из ранних свидетельств бытования основы в русской письменности, хотя сама фамилия Будилин могла сложиться и позже, в XVI–XVII веках, когда фамилии на -ин активно формировались из прозвищ на -а. Суффикс -ин здесь указывает на принадлежность: «сын Будилы».

Таким образом, фамилия Будилин может вести родословную от сторожа-будильщика, от безбородого человека или от человека с древним именем Будимир. Точно определить, какая из версий верна для конкретной семьи, можно только по архивным документам, но все три варианта — часть живой истории русского языка.