Фамилия Будилкин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Будилкин послужило мирское имя Будилка. Мирское имя Будилка, вероятно, получил «тот, кто будит», не дает спать. Такое имя мог получить беспокойный, крикливый ребенок. Согласно другой версии, в основе фамилии Будилкин лежит не имя, а прозвище Будилка, которое связано с глаголом «будить» в значении «побуждать, сподвигать на какие-то действия». В этом случае прозвище Будилка мог получить энергичный человек, способный увлечь своим энтузиазмом других. Веселовского упоминаются: Будило, подьячий, казнен в 1570 г. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Будилка, со временем получил фамилию Будилкин. О точном месте и времени возникновения фамилии Будилкин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Будилкин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.