Фамилия Будилка, скорее всего, образовалась от имени Будилка, которое представляет собой краткую форму славянских имен Будимир, Будислав или, что более вероятно, литовского Будзивил. Имя Будимир ведет свое начало от общеславянских слов «быть» и «мир». Таким образом, его можно перевести как «тот, у кого будет мир». Имя Будислав означает «тот, кто станет славным». Древнее литовское имя Будзивил происходит от слов būtis - «бытие» и viltis - «надежда». Следовательно, его можно перевести как «тот, у кого есть надежда». Менее вероятно, что фамилия Будилка образована от прозвища Будилка – «тот, кто будит, не дает спать». Так могли называть беспокойного ребенка. Кроме того, Будилкой называли человека, который будит людей по должности, по обязанности, а в нижегородских говорах — безбородого мужчину. Веселовского упоминаются однокоренные именования: Будило, подьячий, казнен в 1570 г.