Фамилия Букотин — один из тех родовых имен, чья основа уходит в географические реалии восточнославянского мира. В её центре — прозвище Букота, которое, скорее всего, связано с белорусским словом «букота» — «гора округлой формы» или просто «холм». Это не единственная возможная трактовка, но самая прямая и логичная: прозвище давали человеку, жившему на возвышенности или рядом с ней.

Чтобы понять, почему именно такой корень лёг в основу фамилии, стоит вспомнить, что рельеф Белоруссии равнинный, и любая заметная высота — будь то холм или пологая гора — была ярким ориентиром на местности. Высота таких возвышенностей редко превышает 300 метров (наивысшая точка страны, гора Дзержинская, достигает 345 м). Поэтому для жителя равнины «живущий на букоте» — характеристика точная и запоминающаяся. Со временем прозвище Букота закрепилось за человеком как основное бытовое имя, а его дети и внуки стали писаться Букотиными: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — «сын Буко́ты»).

Словообразовательная модель здесь классическая для русских и белорусских фамилий: основа на -а (Букота) плюс притяжательный суффикс -ин. Такая же схема у фамилий Голота → Голотин, Сирота → Сиротин. Менее вероятно, но не исключено, что в основе лежит диалектный глагол со значением «бубнить, ворчать» (ср. «букотеть» в некоторых говорах), — тогда прозвище относилось бы к манере речи. Однако связь с конкретным географическим объектом выглядит убедительнее: фамилии, образованные от названий форм рельефа, встречаются повсеместно, и Букотин в этом ряду стоит рядом с Холминым, Горкиным или Вершининым.

Фамилия редкая, в современных справочниках массово не фиксируется, что говорит о локальном бытовании — скорее всего, в западных областях России или на востоке Белоруссии. Точное время возникновения установить сложно: процесс формирования фамилий у крестьян и мещан растянулся до XIX века, и Букотины могли появиться как в XVII, так и в начале XIX столетия. Окончательно прояснить историю конкретной ветви помогут только архивные изыскания по месту жительства предков.