Фамилия Букшина — женская форма от фамилии Букшин, а та, в свою очередь, восходит к прозвищу Букша. У этого прозвища есть две основные версии происхождения, и обе указывают на занятие предка.

Первая и наиболее вероятная версия связывает прозвище с русским словом «букша» — так называли втулку в колесе. Следовательно, Букшей могли прозвать мастера, который делал или чинил колёса — колёсника, тележника. Это профессиональное прозвище, распространённое в среде ремесленников.

Вторая версия ведёт происхождение от литовского слова bukšas — «безрогий, комолый». В этом случае прозвище мог получить человек, занимавшийся спиливанием рогов у скота (обезроживанием). Такая работа была распространена в скотоводческих регионах, где лишние рога мешали содержанию животных в стойлах.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Букшин, то есть сын Букши. Форма Букшина — соответственно, жена или дочь Букшина. Географически фамилия тяготеет к западным и северо-западным регионам России, где возможны контакты с балтскими языками, что косвенно поддерживает литовскую версию. Однако и чисто русский корень «букша» в значении «втулка» тоже вполне самодостаточен. Выбор между версиями остаётся открытым, но обе они рисуют портрет предка-ремесленника, а не землевладельца или крестьянина-землепашца.