Фамилия Булхуков — редкий случай, когда основа слова не даёт однозначного толкования на русской почве. Скорее всего, перед нами пример фамилии, образованной от прозвища или имени, имеющего тюркские или монгольские корни. Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель патронимической фамилии: Булхук — сын Булхука, то есть потомок человека по прозвищу Булхук.

Самое правдоподобное объяснение ведёт к калмыцкому или бурятскому слову «булх» (или «булха»), которое может означать «мутный», «мутить», «взбалтывать», а в переносном смысле — «заводила», «зачинщик», «смутьян». В монгольских языках есть слово «булхах» — «мешать», «перемешивать». Прозвище Булхук могли дать человеку с беспокойным, неугомонным характером, который постоянно вносил сумятицу в дела или разговоры.

Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с диалектным русским словом «булдыга» или «бултых», обозначающим шумное падение или плюханье в воду. Однако в этом случае фамилия скорее звучала бы как Бултыхов или Булдыгин. Форма на -ук с твёрдым «х» выдаёт иноязычное происхождение основы.

Географически фамилия Булхуков встречается в основном в южных регионах России, особенно в Калмыкии, а также в Астраханской области и на Северном Кавказе. Это подтверждает версию о калмыцких корнях, так как калмыки долгое время кочевали в низовьях Волги и оставили заметный след в местной ономастике. Если предки носителя фамилии были калмыками, то фамилия могла возникнуть в XIX веке, когда у степных народов начали массово фиксировать фамилии по русскому образцу.

Однокоренных фамилий в русском языке практически нет, что подчёркивает её изолированность. Встречаются варианты написания Булхуков и Булхуков, но ударение, скорее всего, падает на первый слог: Бу́лхуков. Носителям фамилии стоит искать свои корни не в славянских землях, а в монгольском мире, где личное имя или прозвище Булхук могло быть вполне обычным.