Фамилия Бунденкова — женская форма фамилии Бунденков, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель на -енков встречается реже, чем привычные -ов и -ев, и указывает на происхождение от прозвища или имени, оканчивающегося на согласный, с последующим наращением -енк-. По сути, это вариант патронимического суффикса -ов, но с дополнительным элементом, который в русских фамилиях чаще закреплялся в южных и западных регионах (в отличие от северных -их/-ых). Бунденков буквально значит «сын Бунденка» или «потомок Бунденка».

Основа — Бунденко (или Бунденок). В русской ономастике прозвища и фамилии с корнем Бунд- обычно связывают с диалектным глаголом «бундеть» — ворчать, брюзжать, говорить невнятно или сердито. В словарях народных говоров «бундя» — ворчун, «бунда» — человек, который бормочет себе под нос. Таким образом, прозвище Бунденок могли дать неразговорчивому или постоянно недовольному человеку. Версия о связи с немецкой фамилией Бунд (Bund — союз) маловероятна: окончание -енко однозначно указывает на восточнославянскую, скорее всего украинскую или южнорусскую, среду образования.

Если смотреть на географию, фамилия Бунденков (и Бунденкова) не относится к числу широко распространённых. Встречается в основном в центральных и южных областях России, а также на востоке Украины, что согласуется с моделью на -енко. В дореволюционных источниках носители фамилии фиксировались преимущественно среди крестьян и мещан — сословий, где прозвища закреплялись за родом без дворянского оформления.

Таким образом, предок современных Бунденковых был, скорее всего, человеком с заметной чертой характера — ворчливым или молчаливым, от чего и пошло семейное прозвище. Фамилия сохранила редкую словообразовательную форму, которая в XIX веке постепенно вытеснялась более стандартными -ов и -ин, что делает её любопытным примером живой региональной традиции.