Фамилия Бурдюгин звучит грубовато и материально — и это прямое указание на ремесло или торговлю предка. В основе лежит слово «бурдюк»: кожаный мешок для хранения и перевозки вина, кумыса или воды. Такая ёмкость была незаменима у кочевых народов и в южных регионах, где вино держали в бурдюках, а не в бочках. Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Бурдюгин — «сын бурдючника» или «сын человека по прозвищу Бурдюг».

Прозвище Бурдюг могли дать по-разному. Первая и самая прямая версия — по занятию: предок шил бурдюки, торговал ими или возил на них товар. Это мастеровой или мелкий торговец, работавший в местах виноделия или скотоводства — на Дону, Кубани, в Поволжье или в Средней Азии. Вторая версия — переносное прозвище по внешности или характеру: бурдюком в народе называли толстого, неповоротливого человека или того, кто много пьёт. Такие прозвища были обычны для крестьян и казаков, где меткое слово закреплялось на поколения.

Слово «бурдюк» — тюркского происхождения (сравните с турецким «bardak» — сосуд, кувшин), что указывает на контакты с южными соседями. Фамилия Бурдюгин не из самых частых, но встречается в южнорусских областях и у казачества. В центральных губерниях её почти нет — там бурдюки не использовали. Примечательно, что в некоторых говорах слово «бурдюг» означало ещё и «неуклюжий человек» или «лентяй», так что прозвище могло быть и насмешливым, без связи с ремеслом.

Однокоренные фамилии — Бурдюков, Бурдюжский, Бурдюк — образованы от той же основы, но с разными суффиксами. Бурдюгин стоит особняком: суффикс «-ин» чаще встречается у фамилий, образованных от прозвищ на «-а/-я» (Бурдюга, Бурдяга). Возможно, исходная форма была Бурдюга — так могли назвать человека, постоянно носившего с собой бурдюк, либо мастера по выделке кожи. В любом случае, фамилия уходит корнями в быт и хозяйство южных окраин России, где кожаный мешок был вещью привычной и необходимой.