Фамилия Бурдюжан — редкий пример, когда прозвище, лёгшее в основу, не просто называло ремесло или внешность, а указывало на конкретный, почти осязаемый предмет обихода. В её основе — слово «бурдюк»: кожаный мешок для хранения и перевозки жидкостей, в первую очередь вина или воды. Такая тара была незаменима в походах, в степных и горных районах, особенно у народов Кавказа, Средней Азии и юга России. Человек мог получить прозвище Бурдюжан, если делал бурдюки (кожевник-бурдючник), торговал ими или постоянно носил с собой — например, погонщик, водонос или пастух.

Модель образования фамилии выделяет её среди типичных русских фамилий. Суффикс -ан (в варианте -жан, где «ж» возникло из чередования к/ч/ж) характерен для украинской, молдавской и южнорусской ономастики. В русской традиции фамилии чаще образовывали с помощью суффиксов -ов/-ев (Бурдюков) или -ин (Бурдюкин). Форма Бурдюжан — это, скорее всего, украинская или молдавская огласовка, где суффикс -ан придаёт прозвищу оттенок «человек, связанный с бурдюком» или даже «большой бурдюк» (в ироничном смысле — о полном, грузном человеке). В Молдавии и на Буковине такая модель распространена: ср. фамилии Бурдужан, Бурдюжану.

Географически фамилия тяготеет к юго-западу бывшей Российской империи. Её можно встретить среди потомков переселенцев из Бессарабии, Подолья, а также в казачьих областях — на Кубани и Дону, где бурдюки были привычной утварью. В современной России Бурдюжан — фамилия редкая, чаще встречается у носителей с румынскими или украинскими корнями. Спорных версий происхождения у неё почти нет: корень прозрачен, а суффикс однозначно указывает на прозвищную, а не на крестильную основу.