Фамилия Буяндукова — женская форма мужской фамилии Буяндуков, и её разбор стоит начать с неочевидного корня. В основе лежит слово «буян», но не в современном бытовом значении «скандалист, задира». В древнерусском языке и северных говорах «буян» означало «возвышенное открытое место», «площадь», «пристань», а также «торг, базар». Отсюда же пошли слова «буй» (межевой знак, указатель) и «буйный» в смысле «находящийся на виду, открытый». Таким образом, прозвище Буян мог получить человек, живший у торговой площади, на возвышенности, или же тот, кто работал на пристани. Это не про характер, а про место жительства или род занятий.

Суффикс -дуков в фамилии — редкий и требует отдельного пояснения. В русской ономастике модель «основа + -дук» встречается в основном на северо-западе и в бывших новгородских землях. Суффикс -ук/-юк характерен для украинской и белорусской традиции, а -дук — его вариант, который мог закрепиться под влиянием польского или литовского языков. Буяндуков, таким образом, — потомок человека по прозвищу Буяндук, где -дук указывает на принадлежность: «сын Буяна» или «маленький Буян». Это уменьшительно-патронимическая форма, которая со временем превратилась в фамилию.

Географически фамилия Буяндукова привязана к Русскому Северу и Поволжью. В переписных книгах XVII–XVIII веков фамилия встречается среди крестьян и посадских людей Вологодской, Архангельской и Костромской губерний. В этих краях слово «буян» в значении «пристань» было особенно употребительно: волжские и северные речные пристани называли буянами. Предок Буяндуковых мог быть лодочником, грузчиком или купцом, торговавшим на таком буяне.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с тюркским именем Буян (в переводе «богатый, изобильный») и монгольским «буян» (добродетель, заслуга). Однако суффикс -дук больше тяготеет к славянской модели, чем к тюркской, поэтому версия с русским «буяном» как местом выглядит убедительнее.

Фамилия не относится к дворянским — её носители были в основном крестьянами и мещанами. В XIX веке Буяндуковы записаны в метрических книгах Ярославской и Вятской губерний. Современный вариант с окончанием -а (Буяндукова) появился, когда фамилии стали передаваться по женской линии, но этимологически она неотделима от мужской формы.