Фамилия Данилишина образована от мужского крестильного имени Даниил. В переводе с древнееврейского оно означает «мой судья — бог». Но в основу фамилии легла не полная, а производная форма этого имени — Данилиша. Такие «домашние» варианты, оканчивающиеся на -иша, в прошлом были распространены в народной среде, особенно среди крестьян и рабочих. Именно из этой среды, скорее всего, и вышел основатель рода Данилишиных.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность. Фамилия Данилишина буквально означает «жена или дочь Данилиши», а в современном понимании — потомок человека по имени Данилиша. Со временем фамилия закрепилась за родом в целом, утратив прямую связь с полом первого носителя.

Интересно, что форма Данилиша встречается реже, чем привычные Данила или Данилко. Это делает фамилию необычной: она сохранила редкий вариант имени, который в быту почти исчез. По географии бытования фамилия тяготеет к южнорусским и украинским областям, где уменьшительные формы на -иша были более характерны, чем на севере. Таким образом, Данилишина — не просто фамилия от библейского имени, а живая запись народного произношения и словообразования прошлых веков.