Фамилия Дерюженко — один из тех случаев, когда за украинским по форме суффиксом стоит прозвище, связанное с ремеслом. Суффикс -енко, типичный для восточной и центральной Украины, означает «маленький» или «сын», то есть Дерюженко — буквально «сын Дерюжи». Основа фамилии — прозвище Дерюжа, которое восходит к слову «дерюга»: грубый холст, низкосортная ткань из толстой пряжи. В старину дерюгу использовали для мешков, половиков, рабочей одежды — вещь сугубо утилитарная, без намёка на роскошь.

Прозвище Дерюжа могло закрепиться за человеком по-разному. Самая прямая версия — профессиональная: предок ткал или продавал дерюгу. В среде ремесленников и мелких торговцев такие именования по товару встречались сплошь и рядом. Но не исключён и бытовой вариант: прозвище могли дать за привычку носить грубую одежду, за неуживчивый характер (сравните «дерюга» в переносном смысле — нечто жёсткое, негладкое) или просто по внешнему сходству с фактурой ткани. Выбрать одну версию сложно, но профессиональное объяснение выглядит надёжнее: в ономастике прозвища от названий тканей и изделий чаще указывают на занятие, чем на внешность.

Украинская фамилия Дерюженко встречается в документах XX века. В Книге памяти Алтайского края есть запись об Иване Даниловиче Дерюженко, 1921 года рождения, уроженце Акмолинской губернии. Эта запись показательна: она подтверждает, что носители фамилии жили на территории современного Казахстана (бывшая Акмолинская губерния), куда многие украинские крестьяне переселялись в ходе столыпинской аграрной реформы и позже. Фамилия не из самых частых, но и не исчезнувшая — её можно встретить в современных базах данных Украины и юга России.

Сравните с однокоренными фамилиями: Дерюгин (русская форма с суффиксом -ин), Дерюга, Дерюжкин. У всех одна основа — «дерюга», но разные модели образования. Дерюженко выделяется именно уменьшительно-патронимическим суффиксом: это не просто «относящийся к Дерюге», а «сын Дерюжи», что характерно для украинской антропонимической традиции.