Фамилия Доманины — редкий пример метронимической фамилии, то есть образованной не от имени отца, а от имени матери. В основе лежит имя Доманя — просторечная, обиходная форма крестильного женского имени Домна. Само имя Домна восходит к латинскому слову «domina» — «госпожа», «хозяйка». Таким образом, буквальное значение фамилии — «чей-то потомок женщины по имени Доманя».

С церковной историей это имя связано через мученицу Домну Никомидийскую. Согласно житию, она служила языческой жрицей при дворе императора Максимиана, но, прочитав Деяния апостолов, тайно приняла крещение. Вместе с верным слугой, евнухом Индисом, она раздавала драгоценности и пищу бедным, за что была заточена, но, по преданию, ангелы поддерживали их голодающих. Чтобы избежать языческого окружения, Домна притворилась безумной, после чего её удалили из дворца. Она нашла приют в девичьем монастыре, где игуменья Агафия остригла ей волосы и переодела в мужскую одежду. Однако слуги императора разыскали её и казнили.

В русской традиции имя Домна и его производные (Доманя, Домаша) были распространены в крестьянской и мещанской среде. Суффикс -ин в фамилии Доманин указывает на принадлежность: «чей?» — «Доманин сын» или «Доманина дочь». Со временем это родовое прозвание закрепилось за потомками и перестало зависеть от пола родоначальницы. Фамилия встречается преимущественно в центральных и северных областях России, где метронимические фамилии встречаются несколько чаще, чем на юге, — это связано с тем, что в некоторых семьях женщина играла ключевую хозяйственную роль или рано теряла мужа.

Написание фамилии устойчивое, без вариантов вроде «Доманов» или «Доманинский», что говорит о её позднем оформлении в уже сложившихся паспортных списках. Фамилия Доманины — не просто указание на предка, а памятник народной традиции именования, где женское имя могло стать основой для целого рода.