Основой фамилии Донина послужило церковное имя Доня. Имя оня - это производная форма одного из мужских крестильных имен: Авдон (древнееврейское, «слуга, служитель, раб»), Донат (латинское, «подаренный») или Даниил (древнееврейское, «Божий суд»). Скорее всего, основатель рода Дониных был человеком из простого сословия. Согласно другой, менее вероятной гипотезе, фамилия Донина восходит к гидрониму Дон – река, протекающая в Европейской части России. Исходя из этого, можно предположить, что предок Дониных родился или жил на одном из берегов Дона, возможно, был донским казаком. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Доня со временем получил фамилию Донина.