Фамилия Дудкэ — редкий случай, когда написание сразу выдаёт нерусское происхождение. Конечное -э, а не -а или -о, однозначно указывает на молдавскую или румынскую языковую среду. В румынском языке буква ă (а с бревисом) читается как нечто среднее между русским «э» и «ы», и на письме её часто передают просто как «а» или «э». Поэтому фамилию Дудкэ правильнее всего воспринимать как вариант написания фамилии Дудкэ (Дудкэ) или, в русифицированной форме, Дудка.

Основа фамилии — слово «дудэ», что по-румынски значит «дудка», «свирель» или «сопелка». Это народный духовой инструмент, распространённый у пастухов в Карпатах и на Балканах. Соответственно, прозвище Дудкэ (Дудка) могли дать человеку, который играл на дудке — пастуху, музыканту, или тому, кто изготавливал такие инструменты. Суффикс -к- в данном случае уменьшительный или прозвищный, он не образует отчества, а закрепляет за человеком характерный признак.

В Молдавии и среди гагаузов встречается и другая версия: «дудэ» может означать «тыква-горлянка», из которой тоже делали простейшие дудки. Таким образом, прозвище могло относиться и к человеку, выращивавшему такие тыквы или делавшему из них посуду. Но основная версия — музыкантская.

Фамилия Дудкэ распространена в Молдавии и среди молдавской диаспоры в России и на Украине. Встречается и у гагаузов. В русской среде фамилия практически не фиксируется, хотя однокоренные русские фамилии Дудкин, Дудков, Дудников — обычны. Отличие Дудкэ от них в том, что она не прошла через русскую модель образования (с суффиксами -ов/-ев или -ин), а сохранила свою «сырую» прозвищную форму, характерную для юго-западных славянских и романских территорий.