Фамилия Дуганов ведет свое начало от древнетюркского мужского имени Туган. Оно имеет два варианта перевода: «кровный родственник, брат» и «сокол». Имена, образованные от названий хищных птиц, довольно часто встречались у многих восточных народов. Замена начального согласного «т» на «д» в начале имени — довольно частое явление в Средней Азии. Вероятно, фамилия Дуганов является казахской, узбекской или туркменской.