Фамилия Дуканов образована от прозвища или имени Дукан. Основа восходит к тюркскому слову «дукан» (dükkân), заимствованному из арабского и означающему «лавка», «магазин», «торговая палатка». В русских говорах слово «дукан» также закрепилось в значении «мелкая лавка» или «харчевня». Таким образом, прозвище Дукан мог получить владелец торговой точки, либо человек, работавший в такой лавке — приказчик или разносчик товаров.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — сын Дукана). Ударение в фамилии падает на второй слог: Дука́нов, что соответствует ударению в исходном слове «дука́н».

Интересно, что фамилия имеет южный и юго-восточный ареал распространения. Она чаще встречается в регионах, где исторически было сильно тюркское влияние или активная торговля: на Дону, Кубани, в Поволжье, а также среди казачества. В дореволюционных переписях Дукановы фиксировались в Области Войска Донского и в Астраханской губернии. Это не случайно: в приграничных и торговых зонах прозвища, связанные с «дуканом», были особенно понятны и употребительны.

Существует и другая, менее вероятная версия: связь с именем Дука — уменьшительной формой крестильного имени Евдоким (через форму Доким > Дока > Дука). Но в этом случае логичнее было бы ожидать фамилию Дукин или Дуков. Торговая версия выглядит убедительнее, поскольку прямо объясняет и значение, и географию фамилии.

Встречаются однокоренные фамилии Дукан, Дуканкин, Дуканский. Все они имеют общую основу, но различаются способом оформления: Дукан — без суффикса (застывшее прозвище), Дуканкин — с двойным суффиксом (-к- + -ин), а Дуканский — с польско-украинским суффиксом -ский, что указывает на возможное западнославянское или украинское происхождение.