Прозвище Духаня восходит к диалектному западно-русскому или украинскому нарицательному «духаня» со значением «любимый парень». Это нарицательное употреблялось в казачьей среде, а потому можно предположить, что основатель рода Духаниных принадлежал к казачьему сословию. Возможно, Духаней прозвали любимца девушек, завидного жениха или же соблазнителя. Также не исключено, что в основе фамилии лежит мирское имя Духаня. Так родители могли называть горячо любимого ребёнка. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Духаня, со временем получил фамилию Духанина.