Фамилия Духанин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Прозвище Духаня восходит к слову «дух» в одном из значений: «дыхание», «умеренный жар в печи», «запах». Существовали и выражения: «человек с духом» - «стойкий, смелый, храбрый» и «человек с душком» - «упрямый, своенравный, самолюбивый». Менее вероятно, что в основе этой фамилии лежит слово «духан» - «мелочная лавка и шинок на Кавказе». Веселовского записана Духаня Кутепова, помещица, жена Софрона Федотовича, 1597 г., Тула. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Духаня, со временем получил фамилию Духанин. О точном месте и времени возникновения фамилии Духанин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Духанин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.